トランプ大統領によって任命される新FBI長官による捜査を国民が納得するのかという疑問も出ている。

前出のジャーナリストは、「トランプ大統領の陣営が捜査対象になっているのにトランプ大統領が任命したFBI長官が捜査をして、それで結果、何も無かったとなって誰が納得するだろうか？こうなると、ロシアルート（ロシアの選挙関与)の捜査は独立検察官によって行うしかないかもしれない。それは、逆に、トランプ大統領を追い詰めることになるかもしれない」と話す。

トランプ大統領は、解任に際して、「（コミー長官は）私が捜査の対象となっていないと明言してくれて感謝している」とツィートしており、自身を守るための解任ではないと強調している。